Mərkəzi Klinika Gəncə Xəstəxanası Azərbaycan səhiyyəsinə yeni, beynəlxalq standartlara uyğun tibbi xidmət sistemini və təfəkkürünü formalaşdırmaq və həyata keçirməkdən ibarət olan məksədləri:
• Xalqımıza yüksək keyfiyyətli və beynəlxalq standartlara cavab verən tibbi xidmət göstərmək;
• Tibbin ən son nailiyyətləri, müasir texnika və texnologiyalarından istifadə etməklə xalqımıza müasir standartlar səviyyəsində tibbi xidmət göstərmək;
• Azərbaycan vətəndaşlarının xarici ölkələrdə deyil, məhz öz vətənlərində indiyədək həyata keçirilməmiş hər növ tibbi xidmətlər almalarını təmin etmək;
• Yüksək ixtisaslı və müasir səviyyədə tibbi bilik və bacarığa malik milli tibbi kadrlar hazırlamaq;
• Tibdəki yenilikləri tədbiq etmək.